Śmierć Jana Pawła II przyspieszyła budowę i poświęcenie polskiej kaplicy znajdującej się w katedrze. Miesiąc bez jednego dnia po śmierci papieża w dniu 1 maja 2005 roku, arcybiskup Nowego Jorku kardynał Edward Egan konsekrował kaplicę.
Jest to kaplica Matki Boskiej Częstochowskiej, której kopię obrazu wykonała jedna ze znanych kopistek Anna Maria Torwirt z Torunia. Obraz najpierw poleciał do Rzymu, gdzie pobłogosławił go Jan Paweł II.
Wokół ołtarza ustawione są cztery obrazy namalowane przez Leszka Pańkowskiego, który mieszka i maluje w Nowym Jorku. Są na nich polscy święci: Maksymilian Maria Kolbe, Faustyna Kowalska, bp. Stanisław ze Szczepanowa i królowa Jadwiga.
W ołtarzu stoi jeszcze figura św. Kazimierza wyrzeźbiona przez Stanisława Lubistańskiego, mieszkającego w Vermont. Rzeźbiarz osobiście był we włoskim kamieniołomie, aby wybrać dla rzeźby odpowiednią bryłę z białego karraryjskiego marmuru.
Całość otoczona jest pięknym, neogotyckim ołtarzem z białego marmuru, na którym wyryte są dwa wezwania: „Our Lady of Czestochowa, pray for us” oraz „Matko Boska, Królowo Polski, módl się za nami”.
Jan Paweł II był trzy razy w katedrze św. Patryka. Pierwsze dwa razy 2 i 3 października 1979 roku, kiedy przemówił w niej do mieszkańców Nowego Jorku, a na drugi dzień odprawił poranną modlitwę. Trzeci raz, 7 października 1995 roku, kiedy w katedrze odprawił Mszę Świętą.